Après avoir occupé le poste de gouverneur de Montréal pendant 15 ans, François-Marie Perrot est démis de ses fonctions en 1684, pour s’être adonné au commerce clandestin des fourrures. En avril de la même année, il est transféré en Acadie, où il succède au sieur Michel Le Neuf de La Vallière comme gouverneur de l’Acadie. Neveu par alliance de l’intendant de la Nouvelle-France Jean Talon, Perrot a sans doute profité d’avantageuses relations familiales qui lui ont obtenu le gouvernement de l’Acadie.

En août 1684, Perrot arrive à Port-Royal. Il semble bien que son établissement en Acadie n’ait servi qu’à la remise sur pied de son commerce illicite, d’abord avec les Amérindiens puis avec les Bostonnais. Il est d’ailleurs accusé de laisser tomber en ruines les fortifications du fort de Port-Royal et son titre de gouverneur est révoqué en 1687.

Passé au service de la Compagnie de la pêche sédentaire en Acadie, Perrot sera fait prisonnier lors de l’attaque de Sir William Phips en 1690. Relâché, il décèdera l’année suivante en Martinique.